[JSライブラリ]ThickBox

ThickBoxとLightBoxの一番の違いはベースであるライブラリ（フレームワーク）がjQueryかprototype.jsということ。
jQueryを使用しているThickBoxのほうが軽量に動作します。

それぞれのサイトのサンプルを見てみるとLightBoxは画像の拡大のサンプルしかありませんが、ThickBoxはテキストを表示するサンプルやログイン画面を表示させるサンプルが公開されています。

『画像の拡大』という観点よりも『別ウィンドウで表示していたものをページ内で表示させる』という観点で利用方法を紹介しています。

どちらを使うか迷ったら、使用するサイトで利用している他のライブラリとの相性や
用途を考えてより使いやすいと思う方を選択してみてはいかがでしょうか。